Второй по величине правый приток Енисея, впадающий в него около села Туруханск. Ледостав с октября по май. Весеннее половодье в верхнем течении реки в мае-июне, в низовьях — в мае-июле. Длина реки — 2989 км, площадь водосборного бассейна — 473 тыс. км². По характеру течения, строению долины и берегов река может быть разделена на два участка: верхний — от истока до села Преображенского (Преображенка); нижний — от этого селения до устья.
Гидрология: по годовому стоку Нижняя Тунгуска занимает одиннадцатое место среди рек России. Среднегодовой расход воды в устье — 3680 м³/с, что соответствует годовому стоку 116 км³ в год. Минимальный расход наблюдался в 1967 году и составлял 2861 м³/с, максимальный — 4690 м³/с в 1974 году или, соответственно, для устья реки ~3093 м³/с и ~5070 м³/с. Питание реки происходит за счёт таяния снега и летних дождей. В зимнее время река маловодна, так как её бассейн расположен в области вечной мерзлоты и она получает очень скудное грунтовое питание. По наблюдениям в течение 58 лет минимальный среднемесячный расход воды составлял 27,8 м³/с в марте 1969 года — это была необычно сухая зима — в то время как максимальный расход воды в течение месяца доходил до 31 500 м³/с (июнь 1959). На время весенне-летнего половодья приходится 73 % годового стока реки. Амплитуда колебания уровня воды очень велика и является наибольшей из наблюдаемых на основных реках России. В суженных местах наблюдаются мощные заторы льда, при которых уровень поднимается на 30—35 м над меженью. Весенний ледоход на Нижней Тунгуске протекает бурно; следы его действия на берегу видны по отполированным скалам, вырванным с корнем деревьям и пр.[3] В отдельные дни расход воды весенне-летнего половодья достигает 74—112 тыс. м³/с и обеспечивает до 50—70 % объёма стока воды в нижнем Енисее.
Большие притоки: главные притоки Нижней Тунгуски: справа — Ейка, Кочечум, Ямбукан, Виви, Тутончана, Ерачимо, Северная; слева — Непа, Большая Ерёма, Тетея, Илимпея, Нидым, Таймура, Учами. Основным притоком Нижней Тунгуски является р. Кочечум со среднегодовым расходом воды в устье 600 м³/с и площадью бассейна около 100 тыс. км².